Надо залезть. Жидкость может под ковры стекать, они сверху будут сухими.

Так вот в продолжение той темы: Утром пришёл, долил, поехал - печка задула горячим воздухом. Дула минут пять и перестала, а до этого вообще не дула горячим, только холодным, проехал ещё километров пять и опять перегрев машины.

Полезу конечно, а как их снять?

Могу ошибиться, но может удасться. Снизу должны быть резиновые заглушки на днище. Попробуй вытащить ближайшие к моторному щиту и центральному тоннелю.
Пощупай пальцем должно быть сухо. Смотреть надо с обеих сторон центрального тоннеля.
Теперь внимание. Я их не видел, просто думаю они там есть. При вытаскивании заглушек нарушится антикорозийка после установки обратно залить антигравийкой из болончика. Если ближайшие заглушки далеко от моторного отсека, либо от тоннеля сырости можно и не обнаружить.

А центральный тоннель это что?

Не очень клеится версия с отопителем радиатора печки,потому что нет типичных симптомов для такого случая,как запотевание лобового стекла и запаха в салоне.
Сугубо ИМХО.

Летом печку не включают, и думаю в системе вода давно уже.

Четто совсем забыл, а помпа то рабочая?

Помпа рабочая, крыльчатка металлическая и сидит очень крепко, и вязкомуфту новую поставил. Вот термостат старый стоит.
Клапана и доп. помпа рабочие

Сам не смог, а так надеялся. Придётся, наверное, к мастерам обращаться: в двух местах был уже, но как только узнают про систему охлаждения в е39, их энтузиазм сходит на нет.